Japanese Translation of EVOLUTION NEWS & SCIENCE TODAY

https://evolutionnews.org/ の記事を日本語に翻訳します。

ノックアウトと欠失はなぜ機能推定に不十分なのか ― 細胞の「ヴォールト」の謎

This is the Japanese translation of this site.

 

ポール・ネルソン
2023/6/14 11:46

 

先日、UPSがラリー・モランの新刊『What's in Your Genome: 90% of Your Genome Is Junk』(トロント大学出版局) を1冊届けてくれました。トロント大学の生化学の名誉教授であるモランは、インテリジェントデザインの反対者としてよく知られています (しかし、私を含む何人かのID推進者の友好的な知人でもあります。モランと私は、拡張された進化の統合説についての2016年の王立協会の会合で直接会っています)。彼の新著の大部分は、以前に彼のブログ『Sandwalk』で少し違った形で出ていたもので、モランは、「機能的DNAとは、ゲノムからそれが欠失すると個体の適応度が低下するようなDNAの領域のことである」(98ページ)と論じています。

 

モランはこの定義を太字にして、読者が見落とさないようにしています。その方が彼の論議を追いやすいので、私はその点を評価します。しかし、モランは細胞の「ヴォールト」という長年の謎にどのように回答するのでしょうか。これがヴォールトです。

 

画像提供: 田中秀明、加藤公児他、CC BY-SA 3.0 https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0, via Wikimedia Commons.

 

印象的な構造でしょう?これは真核細胞に広く保存されています。ヴォールトは大きく、Wikipediaの項目によれば、リボソームの3倍のサイズです。

よく理解されていない

Wikiの項目には、ヴォールトの機能はよく理解されていないとも書かれています。最も重要なのは、モランの「機能」の定義への直接的な挑戦として、マウスにおいて主要なヴォールトタンパク質をノックアウトしても、表現型を示さなかったことです。

 

これは、ヴォールトに機能的な役割がないことを意味するのでしょうか?もちろん違います。適応度は常に何らかの背景的情報との関係で決まります。(例えば遺伝子を欠失させた場合に) 表現型を示さないことは、「機能がない」ことと等しいわけではありません。同様に、可能性のあるヴォールトの機能を評価するための適切な適応度の背景的情報を見つけることに、私たちにとって分析上の困難があっても、ヴォールトの機能が存在するかどうかについては何も言えません。

 

適応度の尺度やシステムの背景的情報に逆らって機能を評価することの厄介さについての、私の好きな非生物学的実例は、ジュール・ヴェルヌの小説『八十日間世界一周』から来ています。フィリアス・フォッグは大西洋を横断する際に、船上の不必要な物をすべて、蒸気ボイラーとエンジンに給して燃やすことができるように、蒸気船ヘンリエッタ号を船長から買い取ります。1956年の映画版では、燃料とするためにデッキやクラッドなどの多くが取り外されたヘンリエッタ号が描かれています。

 

さて、蒸気船の適応度の背景的情報が「A地点からB地点への輸送」に限定されている観察者は、取り外された資材が何の機能も果たさなかったと誤って推論するかもしれません。しかしそれはナンセンスでしょう。